Čisté izby sa zvyčajne používajú v odvetviach, ako sú farmaceutiká, biotechnológia, elektronika a polovodič. Je potrebné udržiavať extrémne nízke hladiny častíc. Vyžaduje tiež rýchly a ľahký prístup k verejným službám a systémom na údržbu bez narušenia prostredia čistej miestnosti.