Czyste pokoje są zwykle stosowane w branżach takich jak farmaceutyki, biotechnologia, elektronika i półprzewodnik. Musi utrzymać wyjątkowo niski poziom cząstek stałych. Wymaga również szybkiego i łatwego dostępu do narzędzi i systemów do konserwacji bez zakłócania środowiska w czystości.