Čisté pokoje se obvykle používají v průmyslových odvětvích, jako jsou léčiva, biotechnologie, elektronika a polovodič. Musí udržovat extrémně nízkou úroveň částic. Vyžaduje také rychlý a snadný přístup k nástrojům a systémům pro údržbu bez narušení prostředí čisté místnosti.